В будущем, где технологии слились с человеком, киборг-майор Мотоко Кусанаги формирует элитный отряд для борьбы с кибертерроризмом. Расследование теракта в Ньюпорт-Сити приведёт её к опасным открытиям и неожиданным союзникам .
Молодой лейтенант Вега возглавляет отряд спецназа, защищая колонию от таинственных Коллекционеров, похищающих людей. Его ждут невыносимые решения и тяжёлые потери в битве за выживание.